番茄基因组研究进展

作者：唐亚萍; 李宁; 王娟; 王柏柯; 杨生保; 郭斌; 杨涛; 郭春苗; 马凯; 刘君; 王欢^*; 余庆辉^*

来源：新疆农业科学, 2019, 56(02): 197-206.

• 番茄
• 基因组
• 测序技术
• 功能基因

【目的】综述国内外相关高质量番茄基因组研究进展,比较与分析第一、二、三代测序技术的研究成果,为番茄重要性状功能基因的挖掘及新品种选育提供参考。【方法】收集查阅国内外相关官网、文献资料和现有研究前沿技术,整理汇总并进行对比,分析番茄基因组测序技术研究进展。【结果】栽培番茄S.lycopersicum Heinz 1706基因组利用一代和二代测序技术8年完成测序和组装。3个野生番茄基因组采用二代测序技术3年完成,三代测序技术缩短了测序时间,并且在二代测序技术的基础上提高了基因组的质量,提供了完整性高达96.46%的野生番茄品种潘那利的参考基因组。【结论】测序技术推动了番茄基因组研究,三代测序技术与一、二代技术相比,在测序速度、基因序列读长和准确性方面显著提高,也使基因组组装更加精确。

• 单位
  新疆农业大学; 新疆农业科学院; 中国农业科学院生物技术研究所; 中国农业科学院作物科学研究所