近年来,随着我国行政事业单位职能的转变,公共财政制度不断完善,传统的政府会计制度已经无法适应社会发展。针对时代的变革和行政事业单位的发展,我国发布了新的政府会计制度,并将政府会计制度与世界趋同,致使行政事业单位的会计核算模式更加科学,也更有利于会计信息质量的提升。本文在分析新政府会计制度实施背景和重要性基础上,探讨了新政府会计制度在行政事业单位应用中存在的问题,并针对性的提出了加强新政府会计制度在行政事业单位应用的对策措施。