帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析

作者：徐瑞; 陈素文; 段亚飞; 张文文; 王珺; 周传朋; 王芸^*

来源：海洋渔业, 2023, 45(03): 302-313.

DOI：10.13233/j.cnki.mar.fish.2023.03.009

• 帚状江蓠
• UPA基因
• COⅠ基因
• 序列分析
• 系统进化分析

为研究海南省帚状江蓠(Gracilaria edulis)野生群体的种质资源、遗传多样性状况及红藻门物种间亲缘关系，采集海南省文昌和莺歌海潮间带的野生帚状江蓠，采用PCR扩增获得帚状江蓠质体UPA基因片段(质体23S rRNA V区域)和线粒体COⅠ基因片段，分别对其进行序列比较及系统进化分析。结果表明，UPA基因片段T、C、A、G的含量分别为26.2%、16.2%、30.3%、27.3%;COⅠ基因片段T、C、A、G的含量分别为39.2%、15.1%、27.6%、18.1%;UPA和COⅠ基因片段的A+T的平均含量分别为56.5%和66.8%。UPA基因片段长度为370 bp,共检测出1种单倍型，无多态性位点；COⅠ基因片段长度为664 bp,共检测出2种单倍型，3个多态性位点，均为简约信息位点。与UPA基因相比，COⅠ基因具有更高的变异度，更适合用于帚状江蓠遗传多样性的分析。基于UPA和COⅠ基因片段对帚状江蓠进行系统进化分析，两者结果一致，结合形态学分析表明，帚状江蓠应是江蓠属内独立的分支。

• 单位
  中国水产科学研究院南海水产研究所; 上海海洋大学; 生命学院