学界对清代新疆治理的研究以军府制为核心,但长期沿用清人观点,对新疆军府诸多问题探讨不足。本文利用清代满文汉文档案资料,进一步考察新疆军府体系流变,对比其异同,总结其得失,深入阐述清代新疆军府制度及治疆制度的要素、特点、意义及局限。