猪LncRNA基因内L1转座子插入多态与生产和繁殖性状的关联分析

作者：顾浩; 杜站宇; 王宵燕; 王伟; 陈才; 高波; 宋成义^*

来源：扬州大学学报（农业与生命科学版）, 2021, 42(03): 55-60.

DOI：10.16872/j.cnki.1671-4652.2021.03.009

• 大白猪
• 长散在重复序列(LINE)
• LncRNA
• 多态性
• 融合转录本
• 关联分析

LncRNA是长链非编码RNA,在表观遗传学中发挥着重要作用,对蛋白质编码基因的表达起着调节作用,LncRNA基因中存在长散在重复序列(LINE)的插入。通过生物信息学分析、PCR检测和生产性能关联分析等方法鉴定猪LncRNA基因(NONSUSG015048.1和NONSUSG015549.1)中L1插入位点的多态性,探究L1插入LncRNA基因对猪生产和繁殖性能的影响。结果表明:大白猪NONSUSG015048.1基因中无L1插入个体的校正背膘厚度显著大于有插入个体;NONSUSG015549.1基因中无L1插入个体的产活仔数显著多于有插入个体。将L1参考序列与LncRNA转录本序列进行了比对,未发现插入的L1和LncRNA基因形成融合转录本。这说明LncRNA基因中L1插入多态可能与猪校正背膘厚和产活仔数有关联,为这2个分子标记在猪分子育种中的应用提供了参考。

• 单位
  扬州大学