结核分枝杆菌BfrA蛋白的生物信息学分析

作者：逄亚宁; 王聪; 刘奇; 张雷; 李光华^*

来源：医学信息(上旬刊), 2022, 35(06): 81-85.

• 结核分枝杆菌
• BfrA
• Rv1876
• 生物信息学

目的 运用生物信息学方法预测和分析结核分枝杆菌BfrA蛋白的结构和功能。方法 从NCBI数据库中检索基因Rv1876及其编码蛋白Bfr A的基本信息，通过NCBI Blastp工具分析BfrA蛋白与人类蛋白的同源性，采用ProtParam、ProtScale、SOSUI、 TMHMM、 SignalP、 TargetP、 PSORT、 Motif Scan、 SOPMA、 SWISS-MODEL、 BepiPred、 ABCpred、 NetMHCII、NetMHCIIpan、NetCTL、SYFPEITHI和STRING生物信息学在线软件预测及分析其理化性质、亲疏水性、可溶性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、翻译后修饰位点、二级结构、三级结构、B细胞及T细胞抗原表位、蛋白相互作用网络。结果 BfrA蛋白分子式为C802H1276N218O259S7，含有159个氨基酸，理论PI值为4.50，具有稳定性，是一种亲水性可溶性蛋白质；不具有信号肽和跨膜区域，是定位于细胞质的非分泌蛋白；BfrA蛋白二级结构包含α-螺旋（Hh）、β-转角（Tt）、无规则卷曲（Cc）、β-折叠（Ee）；含有4个CK2-磷酸化位点、1个豆蔻酰化位点、3个PKC-磷酸化位点、1个TYR-磷酸化位点；该蛋白含有多个B细胞、Th细胞及CTL细胞抗原优势表位；与hemZ、mmcO、Rv1877、bfrB等蛋白形成相互作用网络。结论 通过生物信息学技术预测到BfrA蛋白具有多个B细胞及T细胞抗原表位，在结核病的预防和诊断方面具有应用前景。

• 单位
  大理大学; 基础医学院