烟草PPO蛋白序列的生物信息学分析

作者：田熙; 薛波; 徐成龙; 杨彦明; 王德勋; 户艳霞; 苏家恩^*

来源：湖南农业科学, 2019, (04): 1-4.

DOI：10.16498/j.cnki.hnnykx.2019.004.001

• 烟草
• PPO蛋白序列
• 生物信息学

烟草PPO蛋白具有功能多样性。为分析其功能,采用NetPhos、swissmodel和TargetP在线工具分析烟草PPO成员的磷酸化位点、三维结构和亚细胞定位。结果显示:NtPPO1、NtPPO2和Nt PPO3均含有丝氨酸位点、苏氨酸位点和酪氨酸位点,其中NtPPO1和NtPPO2的磷酸化位点数(63和64)及排列规律较为相似,而NtPPO3与其具有较大的差异;NtPPO1和NtPPO2的三维结构模板为4z11.1.A,而NtPPO3模板为4z12.1.A,此外,NtPPO1、NtPPO2和NtPPO3的β-折叠主要集中在序列的N端,具有类似于儿茶酚氧化酶的功能;NtPPO1和NtPPO2主要在线粒体中发挥功能。

• 单位
  云南省烟草公司大理州公司