基于多组学数据分析PUF家族基因在肝癌中的表达及其临床意义

作者：唐超峰; 柳科军; 陈本栋; 卜阳^*

来源：宁夏医科大学学报, 2023, 45(07): 668-675.

DOI：10.16050/j.cnki.issn1674-6309.2023.07.004

• 肝细胞癌
• PUF家族基因
• 预后
• 免疫浸润
• 生物信息学

目的 探讨PUF家族基因（PUM1、PUM2、PUM3）作为肝癌的潜在预后标志物及其可能的分子调控机制。方法 TCGA数据库分析PUM1、PUM2、PUM3在正常肝组织、癌旁组织和肝癌组织中的表达及差异；Kaplan-Meier曲线分析PUM1、PUM2、PUM3表达与肿瘤患者预后；c Bio Portal数据库分析PUM1、PUM2、PUM3在肝癌中的突变情况；String网站及Cytoscape软件构建PUM1、PUM2、PUM3共表达基因的蛋白互作网络；GO/KEGG对PUM1、PUM2、PUM3共表达基因进行功能富集分析；TIMER 2.0数据库分析PUM1、PUM2、PUM3与肿瘤免疫细胞浸润的相关性。结果 PUM1、PUM2、PUM3在肝癌组织的表达高于癌旁组织及正常肝组织（P均<0.001）;PUM1、PUM2、PUM3阳性蛋白表达主要集中于细胞核或细胞质；PUM1表达与患者年龄、BMI及组织学分级相关（P均<0.05）;PUM2表达与患者性别、年龄及病理分期相关（P均<0.05）;PUM3表达与肿瘤T分期及病理分期相关（P均<0.05）;PUM1、PUM2、PUM3高表达的肝癌患者预后差（P<0.05）;PUMs共表达基因主要富集于RNA剪切、P53类介质对信号转导的正向调节作用、剪接体组装、转录因子复合体、钙粘蛋白（Ecadherin）结合、P53结合位点及细胞周期等通路。同时PUM1、PUM2、PUM3表达与辅助性T细胞、中枢记忆性T细胞、辅助性T细胞2及嗜酸性粒细胞浸润水平呈正相关关系。结论 PUM1、PUM2、PUM3在肝癌发生发展过程中发挥重要作用，可作为潜在的分子治疗靶点和预后评价标志物。

• 单位
  宁夏医科大学总医院; 宁夏回族自治区人民医院