结核分枝杆菌hemZ蛋白的生物信息学分析

作者：李敏英; 王楚彤; 袁美丽; 李柏青; 许涛; 汪洪涛^*

来源：中国病原生物学杂志, 2021, 16(12): 1382-1392.

DOI：10.13350/j.cjpb.211205

• hemZ蛋白
• 结核分枝杆菌
• Rv1485
• 生物信息学分析

目的 应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌hemZ蛋白的结构和功能。方法 从NCBI中获得hemZ蛋白编码的基因序列，运用生物信息学软件ORF Finder、MEGA、BLAST、Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、SignalP4.1 Server、NetPhos3.1 Server、NetAcet1.0 Server、NetNGlyc1.0 Server、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、STRING、MEGA等工具对Rv1485基因编码蛋白hemZ的结构和功能等相关的生物学信息进行预测。结果 hemZ蛋白由Rv1485基因编码，该基因全长1 035 bp,有8个开放阅读框，由344个氨基酸组成，等电点为5.69,跨膜氨基酸数为0.074 36,无信号肽、乙酰化位点和N-糖基化位点，有23个磷酸化位点；蛋白二级结构中α-螺旋占43.31%,β-折叠占11.63%,β-转角占2.33%,无规则卷曲占42.73%;有10个B细胞抗原表位和14个T细胞抗原表位；hemZ蛋白存在于致病性分枝杆菌中，且在其他分枝杆菌中存在相似序列。结论 预测结核分枝杆菌hemZ蛋白具有磷酸化位点及良好的T、B细胞表位，且有多个互作蛋白，可作为结核病多肽疫苗的重要候选蛋白。

• 单位
  蚌埠医学院