基于ITS2序列的十大功劳属植物分子鉴定及亲缘关系分析

作者:潘春柳; 姚李祥; 罗棪珍; 黄宝优; 农东新; 余丽莹*
来源:中药材, 2021, 44(06): 1330-1336.
DOI:10.13863/j.issn1001-4454.2021.06.008

摘要

目的:基于ITS2序列对十大功劳属植物进行分子鉴定,并确定其亲缘关系。方法:收集十大功劳属植物29份及外类群植物4份,对ITS2区段进行PCR扩增和测序,使用Mega 6.0软件进行序列变异分析,利用ITS2 database在线工具预测ITS2序列二级结构,并采用NJ邻接法构建系统进化树。结果:十大功劳属植物ITS2序列长度均为223 bp,平均GC含量52.5%~55.2%。保守位点共203个,变异位点共20个,种间遗传距离大于种内遗传距离。依据ITS2序列二级结构,可直观地将小果十大功劳、阔叶十大功劳和十大功劳与该属其他植物明显区分。基于ITS2序列的NJ进化树基本可以阐述十大功劳属植物的种间关系。小果十大功劳和十大功劳聚为一支,它们的亲缘关系较为接近。宜章十大功劳以87%的支持率与外类群小檗属植物聚为一支,阔叶十大功劳与绿药淫羊藿聚为一支,说明十大功劳属与小檗属和淫羊藿属的关系也很近。结论:ITS2序列在十大功劳属植物的物种真实性鉴定方面具有良好的应用价值。

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