基于高通量测序技术分析家兔感染猪瘟兔化弱毒株后脾脏的转录组学变化

作者：侯玉臻; 赵丹彤; 刘国英; 贺番; 刘斌; 付绍印; 郝永清; 张文广

来源：病毒学报, 2016, (03): 316-323.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002945

• 猪瘟兔化弱毒株
• 家兔脾脏
• 转录组分析 Hog cholera lapinized virus
• Rabbit spleen
• Transcriptome analysis

本研究基于高通量测序技术对感染猪瘟兔化弱毒株(C株)后0h,12h,24h,30h,36h,48h的家兔脾脏组织进行测序,以家兔基因组作为参考,筛选感染后各时间点和对照组(0h)之间的差异基因。利用Uniprot和NCBI数据库查找各组中变化水平显著的前10个差异基因的生物学功能。结果发现,感染后12h,24h,30h的前10个差异基因只有少数与炎症、免疫、凋亡等相关;感染后36h,48h的前10个差异基因完全相同,其中B2M、RLA-DR-ALPHA、CD74和IGJ参与抗病毒过程。GO功能注释结果显示:感染后各时间点的差异基因都和免疫、代谢、调控途径紧密相关。KEGG通路富集分析发现,感染...

• 单位
  集宁师范学院; 内蒙古自治区农牧业科学院; 金宇保灵生物药品有限公司; 内蒙古农业大学