基于高通量测序与分离鉴定方法解析奉节和巫山鲊广椒微生物多样性

作者：张振东; 李学富; 肖秋杨; 詹捷; 赵慧君; 郭壮; 王玉荣^*

来源：食品与发酵工业, 2023, 49(24): 178-185.

DOI：10.13995/j.cnki.11-1802/ts.034967

• 鲊广椒
• 细菌多样性
• 高通量测序
• 分离鉴定
• 乳酸菌

为解析重庆地区鲊广椒微生物菌群结构特点，结合高通量测序技术与分离鉴定方法，对重庆地区巫山与奉节采集的鲊广椒菌群进行了分析。结果发现，这两个地区的鲊广椒的优势属有11个，其中乳杆菌属(Lactobacillus),促生乳杆菌属(Levilactobacillus),迟缓乳杆菌属(Lentilactobacillus),伴生乳杆菌属(Companilactobacillus),魏斯氏菌属(Weissella)和普雷沃菌属(Prevotella)含量大于5%。值得注意的是，从巫山鲊广椒检测到了丰度较高的普雷沃菌属和梭菌属(Clostridium)。基于线性判别分析效应值(linear discriminant analysis effect size, LEfSe),普雷沃菌属和塔特姆菌属(Tatumella)分别作为巫山和奉节鲊广椒的生物标志属。通过分离鉴定，从重庆地区鲊广椒中分离到了18株乳酸菌，鉴定为8个菌属。结合高通量测序技术与分离鉴定方法，可将重庆地区鲊广椒的优势属促生乳杆菌属和迟缓乳杆菌属分别鉴定为短促生乳杆菌(Levilactobacillus brevis)和布氏迟缓乳杆菌(Lentilactobacillus buchneri)。该研究预期能为鲊广椒的产业化发展提供菌株资源与数据支撑。

• 单位
  黔南民族师范学院; 湖北文理学院