天津地区鸡源沙门氏菌的基因分型研究

作者：王骁; 赵处敏; 康青; 杜婷; 李萍; 杜欣军^*; 王硕^*

来源：食品安全质量检测学报, 2022, 13(14): 4487-4493.

DOI：10.19812/j.cnki.jfsq11-5956/ts.2022.14.054

• 沙门氏菌
• 脉冲场凝胶电泳
• 核心基因组多位点序列分型
• 功能基因分型

目的 研究并评估几种分子分型方法对亲缘关系相近鸡源沙门氏菌的分辨能力。方法 针对2015—2016年从天津市大型市场和超市中分离的106株沙门氏菌及其全基因组测序结果,分析了沙门氏菌的血清型、序列类型(sequence types, STs),并通过脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)、核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing, cgMLST)以及一种基于59个基因的分型方法对沙门氏菌进行分子分型研究。结果 106株沙门氏菌共分为8种血清型和8个ST型;PFGE分型方法将沙门氏菌分为7个集群; cgMLST将沙门氏菌分为8个集群; 59个基因的分型方法将亲缘关系相近的分离株分为9个集群。结论 肠炎沙门氏菌为这些沙门氏菌中的优势亚型; cgMLST具有最高的分辨率;基于59个基因的分型方法可以满足对亲缘关系相近沙门氏菌的分型研究。

• 单位
  南开大学; 天津科技大学