御谷RAV1基因及启动子的克隆与生物信息学分析

作者：周梦蝶; 王泽玉; 王辰雨; 杜娟; 宋剑灵; 刘华; 陈曙; 解新明^*; 钟天秀^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(15): 4880-4890.

DOI：10.13271/j.mpb.020.004880

• 御谷
• RAV
• 启动子
• 生物信息学分析

RAV (Related to ABI3/VP1)是一种植物所特有的转录因子。作为关键转录因子，RAV基因家族广泛参与了植物生长发育的过程，以及植物对非生物胁迫和生物胁迫的反应。本研究以御谷(Pennisetum glaucum)为实验材料，通过mhiTAIL-PCR (modified high-efficiency thermal asymmetric interlaced PCR)技术分别获得930 bp PgRAV1基因序列和该基因2 413 bp的启动子序列。对PgRAV1基因及启动子进行了生物信息学分析，分析结果显示，PgRAV1基因共编码309个氨基酸，不存在跨膜结构。多重序列比对表明，PgRAV1基因含有AP2和B3保守结构域。用MEGA 7.0构建了系统进化树，结果显示御谷、小米(Setaria italica)和粳稻(Oryza sativa subsp. japonica)聚类在一起，均为禾本科植物。蛋白质二级结构和三级结构上由α-螺旋结构、延伸链、β-转角、无规则卷曲组成功能域，其比例分别占氨基酸总数的28.16%、18.77%、5.83%、47.25%。启动子分析预测显示有一个转录起始位点及大量顺式作用元件。对御谷PgRAV1基因及启动子的研究表明该基因可能通过参与植物激素的信号转导过程来参与植物生长发育。本研究为御谷的抗逆研究提供了理论依据和实践基础。

• 单位
  兴义民族师范学院; 华南农业大学; 青海省草原总站