基于高通量测序的福建北部马铃薯晚疫病株根际土壤细菌群落分析

作者：李华伟; 罗文彬; 许国春; 刘中华; 林志坚; 许泳清; 纪荣昌; 邱思鑫^*; 汤浩^*

来源：微生物学通报, 2022, 49(03): 1017-1029.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.210532

• 马铃薯
• 晚疫病
• 根际微生物
• 多样性

【背景】马铃薯晚疫病是一种由致病疫霉[Phytophthora infestans (Mont.) de Bary]引起的毁灭性病害，当环境条件适宜时，残留在土壤中的病原菌会侵染马铃薯植株导致病害的发生。【目的】明确健康马铃薯植株与发病植株的根际土壤细菌结构与多样性。【方法】采集马铃薯晚疫病发病地的健康植株根际土壤(M2J)和发病植株根际土壤(M2G)，对土样中的细菌群落进行基于Illumina Mi Seq测序平台的宏基因组高通量测序分析。【结果】发病植株根际土壤细菌的优质序列比健康植株少3.31%(1 747条)，OTU少24.58%(1 466个)。在门水平上，健康植株和发病植株根际土壤微生物组成相似，但相对丰度存在显著差异。其中发病后植株根际土壤菌群变形菌门(Proteobacteria)相对丰度增加17.70%，绿弯菌门(Chloroflexi)相对丰度增加了1.58%，而酸杆菌门(Acidobacteria)相对丰度降低了6.13%，放线菌门(Actinobacteria)相对丰度降低了4.28%，芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)相对丰度降低了1.41%，疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度降低了3.11%。在属水平上，发病植株根际的Rhodanobacter和鞘氨醇单孢菌属(Sphingomonas)相对丰度比健康植株增加了8.63%和3.51%；而Vicinamibacteraceae、norank＿f＿＿norank＿o＿＿Vicinamibacterales、norank＿f＿＿Gemmatimonadaceae、Chujaibacter和黄杆菌属(Flavobacterium)的相对丰度低于健康马铃薯植株。【结论】感染马铃薯晚疫病后的植株根际土壤细菌结构和多样性显著低于健康植株，细菌菌落多样性降低，且部分优势细菌门、属类群占比发生改变。

• 单位
  福建省农业科学院