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摘要
目的通过生物信息学分析前列腺癌基因表达芯片谱, 寻找与前列腺癌发生及转移相关的枢纽基因。方法使用GEO2R分析基因芯片数据集GSE27616, 分别获得4个良性前列腺和5个局限性前列腺癌组织样本的差异表达基因(DEGs)、5个局限性前列腺癌和4个转移性前列腺癌组织样本配对的DEGs, 将两组DEGs取交集后得到最终DEGs。使用DAVID数据库进行GO分析、KEGG通路富集分析, 使用STRING数据库进行蛋白互作网络分析。应用Cytoscape软件中的Cytohubba 筛选得到20个枢纽基因。通过GEPIA数据库进行验证和生存分析比较。结果最终获得DEGs 388个, 其中上调基因60个, 下调基因328个。KEGG分析发现DEGs主要富集于局灶性粘连、cGMP-PKG、Rap1、cAMP等信号通路。GEPIA分析20个枢纽基因, 发现TOP2A、BIRC5、CENPF、FGF2在前列腺癌和良性组织中表达水平不同(P<0.05)。进一步筛选发现CDK1、EZH2、TOP2A、HMMR、CCNB2、CENPA、CDC45、FOXM1、BUB1、CDCA8、DLGAP5、NUSAP1、BIRC5、OIP5、CDCA5、KIF4A、CENPF、FGF2与前列腺癌患者无瘤生存相关, NUSAP1、BIRC5、CDC6、CDCA5与前列腺癌患者总生存相关。结论通过生物信息学筛选前列腺癌基因芯片得到的枢纽基因可能为前列腺癌发生及转移的进一步研究提供线索, 可为前列腺癌诊疗提供新的有价值的靶点。
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单位无锡市第五人民医院; 无锡市锡山人民医院
