2014-2018年广西柳州市HCV的基因型和1b亚型NS5B区的序列特征

作者：尹琦; 罗洲; 陈钦艳; 杨庆利^*

来源：中华疾病控制杂志, 2020, 24(10): 1228-1232.

DOI：10.16462/j.cnki.zhjbkz.2020.10.023

• 丙型肝炎病毒
• 基因型
• HCV 1b
• NS5B区
• 变异

目的分析2014―2018年广西柳州市丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的基因型分布和HCV 1b亚型NS5B区的序列特征。方法收集慢性丙型病毒性肝炎患者血清,提取HCV RNA,反转录后用巢式PCR扩增NS5B区序列,测序后构建进化树分析HCV基因型和基因亲缘关系。用聚类分析法对比HCV 1b本地群、非本地群和参照株NS5B区基因和蛋白序列的差异。结果广西柳州市HCV流行的基因型包括1a、1b、2a/c、3a、3b、6a、6c/d和未分型(NT),分别占3.39%、43.01%、0.42%、13.98%、6.99%、28.81%、3.18%和0.21%;HCV 1b亚型中61.6%的病毒与各参照株进化距离均较远,其比例在2014―2018年分别占HCV 1b亚型的69.8%、78.6%、43.3%、47.6%和59.6%;该群HCV的NS5B基因有15个经常性突变位点,可导致NS5B蛋白I2682V和S2755N发生经常性变异。结论广西柳州市HCV流行的主导基因型依次为1b、6a和3a;HCV 1b亚型中的大部分属于本地亲缘性群,该群HCV的NS5B蛋白存在特征性的变异位点并可能影响直接抗病毒药的作用。

• 单位
  广西壮族自治区疾病预防控制中心; 广西中医药大学; 柳州市柳铁中心医院