肺腺癌CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4基因簇表达预后意义TCGA数据库资料分析

作者：王玉秀; 王丽萍; 闵凌峰^*

来源：中华肿瘤防治杂志, 2019, 26(23): 1777-1790.

DOI：10.16073/j.cnki.cjcpt.2019.23.06

• 肺腺癌
• 癌症基因组图谱数据库
• CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4基因簇
• 预后

目的尼古丁乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptor,nAChR)作为一种尼古丁依赖相关性受体,其与吸烟行为以及吸烟量存在明显相关性,然而其在吸烟作为主要危险因素的肺癌发生发展中是否有重要作用目前尚罕见报道。本研究探讨nAChR在肺腺癌组织中的表达情况,以及CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4基因簇在肺腺癌组织中的表达及预后意义。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库收集486例肺腺癌数据集,下载CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4基因簇表达谱资料及临床信息资料。应用免疫组化方法检测江苏省苏北人民医院2015-07-01-2017-12-31收治60例肺腺癌患者CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4基因簇表达情况,分析其与临床病理特征关系及对预后的影响。采用基因集富集分析(genes enrichment analysis,GSEA)方法预测CHRNA5的调控基因。结果 CHRNA5基因表达水平与患者吸烟情况(χ2=20.175,P<0.001)、总生存期(overall survival,OS;χ2=19.113,P<0.001)及无复发生存期(recurrence free survival,RFS;χ2=22.116,P<0.001)有关联,CHRNB4基因表达水平与吸烟情况(χ2=4.523,P=0.034)以及OS(χ2=18.071,P<0.001)有关联。CHRNA5 mRNA表达水平与患者预后有关联,χ2OS=6.666,P=0.010;χ2RFS=8.239,P=0.004。CHRNA5高表达患者OS以及RFS短于低表达患者。免疫组化结果示,肿瘤恶性程度越高,CHRNA5表达越高。60例肺腺癌患者CHRNA5阳性表达率为58.3%(35/60)。CHRNA5高表达样本富集到细胞循环、骨架蛋白调控、紧密连接和TGFβ通路等基因集。结论在肺腺癌组织中,CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4基因簇高表达是一种预后不良因素。CHRNA5可以作为预测患者转移及判断预后的有效生物标志物。

• 单位
  江苏省苏北人民医院; 扬州大学; 大连医科大学; 第二临床学院