铁蛋白结构和功能的生物信息学分析

作者：窦承贤; 方敏全; 梁晋涛^*; 李桂银^*

来源：生物技术, 2023, 33(01): 33-67.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.01.0006

• 铁蛋白
• 重链
• 轻链
• 肝癌
• 互作蛋白
• 铁死亡

[目的]通过生物信息学方法探究铁蛋白的结构和功能的相关信息，研究铁蛋白与肝癌的潜在关系。[方法]从NCBI获取铁蛋白序列，分别使用ProScale、TMHMM、NCBI-CDD和Prosite工具分析铁蛋白的亲疏水性、跨膜区、功能结构域和生物活性位点。使用SOPMA、PSIPRED和SWISS-MODEL平台预测了铁蛋白的二级结构和三级结构。进一步，基于STRING数据库研究了铁蛋白的互作蛋白和富集通路。[结果]铁蛋白是一种亲水性蛋白，无跨膜区，存在1个铁蛋白样二铁氧化的功能结构域和2个生物活性位点，具有较高的螺旋程度。铁蛋白与RPS17、TFRC、SCARA5、NCOA4和COX8A五种蛋白相互作用，这些蛋白显著富集在铁死亡与矿物吸收富集途径，与癌症的发生有关。[结论]对铁蛋白进行生物信息学分析，预测了铁蛋白重链和轻链的理化性质和空间结构，也从其功能上揭示了与肝癌的潜在关系，为深入研究提供了理论基础。

• 单位
  广东石油化工学院; 桂林电子科技大学