基于真实世界数据奥密克戎BA.5.2变异株传播动力学参数估算

作者：刘天; 徐琴雯; 何诗琪; 阮德欣; 黄继贵; 毛安禄^*

来源：疾病监测, 2023, 38(04): 457-461.

• 潜伏期
• 世代间隔
• 代际间隔
• 基本再生数
• 新型冠状病毒肺炎
• 奥密克戎BA.5.2

目的 利用湖北省荆州市2起由奥密克戎BA.5.2变异株引起的局部疫情数据，估算奥密克戎BA.5.2变异株的传播动力学参数，为认识奥密克戎BA.5.2变异株传播能力提供科学依据。方法 采用自行设计表格收集2起疫情中感染关系明确的感染者与被感染者的感染时间、发病时间及首次核酸阳性采样时间等数据。对获得数据分别拟合对数正态分布、伽马分布和伽马分布计算潜伏期、世代间隔(GT)、代际间隔(SI)。分别采用指数增长模型(EG)和极大似然估计法(ML)计算基本再生数(R0)，取R2较大者作为R0估算值。结果 荆州市2起疫情中，疫情A为外市来荆人员在荆州市进行社交活动引起，主要通过同住、同餐、同娱乐和同工作传播，为常见社交传播情形；疫情B涉及人群聚集的批发市场，首发病例进入后停留3 h后随即离开，在农贸市场快速传播并外溢至同住人员，为人群密集场所传播情形。2起疫情共计纳入感染者与被感染者39对52例的数据用于潜伏期、GT和SI估算。潜伏期中位数为2.52 d(44例，1.32～4.84 d),SI中位数为2.13 d(37例，1.63～2.64 d),GT中位数为1.91 d(21例，1.05～3.15 d)。疫情A、疫情B最优拟合模型均为EG模型，对应R2分别为0.62、0.88。疫情A、疫情B拟合的R0分别为5.33(95%CI:2.08～13.44)、22.58(95%CI:7.23～91.36)。单次暴露感染者观察到暴露至检出最短时间为20～21 h。结论 奥密克戎BA.5.2变异株具有潜伏期短、传播速度快、传染性强的特点。在人群密集场所，奥密克戎BA.5.2变异株传播能力极强。

• 单位
  长江大学