谷子PLATZ转录因子基因家族的鉴定和分析

作者：孙蓉; 杨宇琭; 李亚军; 张会; 李旭凯^*

来源：植物学报, 2023, 58(04): 548-559.

• PLATZ
• 谷子
• 全基因组鉴定
• 组织特异性表达
• WGCNA

PLATZ转录因子家族是一类植物特异性锌依赖DNA结合蛋白,在植物生长发育和抗逆过程中发挥不可或缺的作用。然而,对于谷子(Setaria italica) PLATZ家族基因尚未进行系统研究。在谷子基因组中鉴定出17个PLATZ基因并对其进行系统命名。通过系统发育分析将SiPLATZ基因划分为5个亚家族,同一亚家族成员具有相似的基因结构和保守基序。顺式作用元件分析表明,SiPLATZ基因可能在籽粒胚乳发育和多种抗逆反应中发挥作用。Ka/Ks分析表明,重复基因受到纯化选择。SiPLATZ基因在不同组织和发育阶段的表达存在显著差异,主要包括在根、叶和茎中高表达,以及在穗和籽粒中高表达两类,这体现出SiPLATZ基因生理功能的复杂性,其可能参与调节籽粒生长和多种抗逆反应。此外,结合WGCNA分析构建的共表达网络,发现SiPLATZ6、SiPLATZ8、SiPLATZ9和SiPLATZ11可能是谷子产量遗传改良和功能基因研究的候选基因。研究结果为深入揭示PLATZ转录因子在谷子生长发育中的生物学功能奠定了基础。

• 单位
  生命科学学院; 山西农业大学