精神分裂症伴迟发性运动障碍患者基因甲基化谱的初步构建

作者：张苹; 李艳丽; 安会梅; 谭云龙^*

来源：中华精神科杂志, 2018, 51(01): 13-19.

• 运动障碍, 药物性
• 精神分裂症
• 甲基化
• 表观遗传

目的运用甲基化DNA免疫共沉淀联合高通量测序(methylated DNA immunoprecipitation coupled with next-generation sequencing, MeDIP-seq)技术初步构建伴迟发性运动障碍(tardive dyskinesia, TD)精神分裂症患者的基因甲基化谱。方法入组伴TD精神分裂症患者5例(TD组)、不伴TD精神分裂症患者5例(非TD组)及健康志愿者5名(对照组), 提取外周血全基因组DNA, 制备MeDIP-seq文库。采用Agilent 2100生物分析仪质控评估MeDIP-seq文库后使用Illumina HiSeq 2000测序平台进行高通量测序。依次使用Off-Line Basecaller V1.8、BOWTIE V2.1.0及MACS V2对测序结果进行分析处理, 再通过MACS V2识别每个样本的全部MeDIP峰, 统计阈值设为富集倍数>2, 同时q<10-5。人口学及临床资料统计检验水准为α<0.05。结果 3组年龄(F=0.13)、受教育年限(F=0.23)、性别(χ2=10-13)差异均无统计学意义(均P>0.05);TD组与非TD组病程(t=-0.39)、用药时长(t=-0.68)差异均无统计学意义(均P>0.05)。TD组、非TD组和对照组启动子区MeDIP峰相关基因数分别为1 731、1 673和1 728个, TD组与对照组差异基因数为161个, 与非TD组的差异基因数为372个, 其中161个为TD组与非TD组及对照组的共同差异基因数。结论本研究初步构建了伴TD精神分裂症患者的基因甲基化谱, 为后续研究限定目标基因范围提供了一定依据, 但DNA甲基化在TD发生中的具体作用还需要进一步研究。

• 单位
  北京大学; 北京回龙观医院