草鱼出血病分子流行病学及GCRV多样性研究

作者：黄毅昌; 雷燕; 杨玉滔; 闫秀英; 简纪常; 吴灶和

来源：安徽农业科学, 2016, 44(11): 120-153.

DOI：10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.11.041

• 草鱼呼肠孤病毒
• 草鱼出血病
• 分子流行病学
• 多样性

[目的]分析不同基因型GCRV分离株与患草鱼出血病草鱼症状的相关性。[方法]采用RT-PCR检测患病草鱼,应用生物信息学方法分析基因型内和基因型间不同分离株间的差异。[结果]对近3年来草鱼出血病分子流行病学分析发现,患草鱼出血病病鱼多为"肠炎型"症状,且检测发现其病原多属于GCRV基因型Ⅲ型。对GCRV的多样性分析表明,不同分离株同源蛋白的同源率高达93%以上,却被给予完全不同的名称,给GCRV多样性研究带来一定的困难;同一基因型不同分离株同源蛋白间的变异位点较少,且功能位点发生变异的更少;不同基因型不同分离株同源蛋白间的保守位点较少,且这些保守位点中只有极少数位点为功能位点;不同基因型分离株同源结构蛋白间存在较大的差异,且同源非结构蛋白间的差异更为显著。[结论]草鱼出血病不同临床症状可能与其病原基因型不同有关。

• 单位
  广州利洋水产科技股份有限公司; 广东海洋大学; 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室