绵羊痘病毒ORF121基因的序列分析及其B细胞表位预测

作者：陈轶霞; 乔自林; 刘俊林; 王明明; 陆会宁; 郑亚东; 陈智华

来源：黑龙江畜牧兽医, 2009, (03): 16-18.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2009.03.003

• 绵羊痘病毒
• ORF121
• 序列分析
• B细胞表位 Sheeppox virus
• ORF121glycoprotein
• sequence analysis
• B cell epitopes

选取GenBank上4株不同绵羊痘毒株ORF121基因序列,采用DNASTAR软件对该基因序列进行同源性分析,并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据,综合预测ORF121蛋白B细胞表位。结果表明:4株不同绵羊痘毒株ORF121基因核苷酸序列的同源性为99%;在ORF121蛋白的肽链中,35～46、76～82、160～167区段亲水性强,35～45、54～83、90～124、130～139、144～158和160～167区段柔韧性好,37～45、112～116、129～137和143～167区段抗原指数高,33～45、78～83和159～167区段表面可及性高,30～57和151～170...

• 单位
  家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 甘肃农业大学; 西北民族大学; 中国农业科学院兰州兽医研究所