长链非编码RNA在Kaposi肉瘤组织中的表达

作者：刘治全; 袁虎; 普雄明^*

来源：中国麻风皮肤病杂志, 2020, 36(08): 467-472.

• Kaposi肉瘤
• 长链非编码RNA
• 基因芯片
• 实时荧光定量PCR

目的:检测长链非编码RNA(lncRNA)在Kaposi肉瘤组织和瘤旁正常组织中的表达。方法:利用高通量lncRNA芯片技术检测5例Kaposi肉瘤组织及其瘤旁正常组织的lncRNA表达谱,筛选差异表达的lncRNA,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法进一步验证芯片结果,同时采用生物信息学分析差异lncRNA靶基因KEGG通路注释。结果:与正常组织相比,Kaposi肉瘤组织中共筛选出717个差异表达的lncRNA,其中上调表达408个,下调表达309个;与正常组织相比,lnc-PXDN-3:3和lnc-PERP-10:2在Kaposi肉瘤组织中均表达上调,与芯片结果一致。生物学过程注释集中在Wnt信号通路、泛素化代谢、TGF-beta信号通路、P53信号通路。结论:lncRNA可能与Kaposi肉瘤发病有关。

• 单位
  新疆维吾尔自治区人民医院; 石河子大学; 湖南省中医药研究院附属医院