趋化因子CCL5在肾透明细胞癌发生发展中的作用

作者：安云昭; 张珩; 田野; 安凌悦; 罗光恒^*

来源：泌尿外科杂志(电子版), 2022, 14(04): 52-57.

DOI：10.20020/j.CNKI.1674-7410.2022.04.11

• 肾透明细胞癌
• 差异表达基因
• 生物信息学
• 趋化因子
• CCL5

目的 探讨趋化因子CCL5 （C-C chemokine ligand 5）在肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma,ccRCC）发生发展中的作用。方法 使用生物信息挖掘技术对GSE36895、GSE46699、GSE53757基因表达谱芯片数据集进行分析后取交集得到差异表达基因（differential expressed genes,DEGs）,使用STRING数据库及Cytoscape的cytoHubba应用程序得到蛋白质互作网络（protein-protein interaction networks,PPI）及关键基因并进行排序,最后将所得关键基因在癌症基因组图谱（the cancer genome atlas,TCGA）及基因型-组织表达（genotype-tissue expression,GTEx）数据库中进行验证。随后使用细胞及动物实验验证CCL5对透明细胞癌细胞增殖的影响。结果 通过对GEO （Gene Expression Omnibus）数据库ccRCC的三个数据集使用R软件等工具进行分析,共得到934个DEGs,其中上调504个,下调430个。构建DEGs的PPI互作网络并通过cytoHubba筛选出最重要的10个基因并与TCGA及GTEx数据库数据进行对比,研究发现了趋化因子家族相关基因在ccRCC发生发展中起重要作用。与空白对照组比较,EdU检测提示CCL5沉默组786-o细胞的增殖显著减少（P<0.05）,CCK8检测提示CCL5沉默组786-o细胞的增殖显著亦减少（P<0.001）。通过小鼠异种移植肿瘤模型实验发现,相较空白对照组,在第50天,CCL5沉默组的肿瘤体积明显低于对照组（P<0.001）。结论 趋化因子CCL5在ccRCC发生发展中起到了重要作用。

• 单位
  贵州省人民医院