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摘要
为探索秋茄(Kandelia obovata)叶片发育过程中物质合成和基因表达情况，本研究对红树叶片三个发育时期的m RNA进行提取和高通量测序，获得高质量序列(Clean reads) 64 189 053个，高质量碱基19.29 Gb，共组装获得转录本108 077个，转录本长度大于2 000 bp的为37 206个，200～300 bp的转录本11 797个, Q30均在95.00%左右。通过对红树秋茄叶片三个不同时期(初期，中期，成熟期)的差异基因进行KEGG富集分析，结果发现，差异基因主要富集在以下代谢途径：碳水化合物代谢途径(淀粉和蔗糖代谢)，苯丙氨酸代谢，能量代谢途径，植物激素信号调控，生物碱合成，脂质代谢途径，昼夜节律信号转导途径。GO富集分析表明，差异基因主要富集在生物学过程(包括转录调控, DNA复制,蛋白磷酸化等)，细胞组分(包括细胞核,细胞膜,叶绿体,线粒体等)，分子功能(包括DNA结合,蛋白结合等)，另外在秋茄叶片发育的三个时期共统计到22 333个SSR位点，占比最高的为单核苷酸，数量为12 268条，其次为三核苷酸和二核苷酸，分别6 410条和3 245条，这些结果为红树秋茄分子标记辅助育种提供了重要依据，由于秋茄是非泌盐性红树品种，通过对成熟红树叶片进行扫描电镜的观察，发现红树叶片上表面无气孔结构，下表面分布有大量气孔，同时对叶片表面进行了元素种类和含量的分析，发现红树叶片下表面的钠离子和硫离子含量比叶片上表面高，同时在靠近叶片下表面的细胞中，发现了可能储存盐分的结构，这些结果为研究非泌盐性红树的叶片的生长发育提供了一定的理论基础。
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