结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络

作者：邓巧玲; 柳家翠; 喻明霞; 李胜^*

来源：西部医学, 2020, 32(02): 166-170.

• 结直肠癌
• TCGA
• 肿瘤标志物
• 内源性竞争性RNA

目的构建结直肠癌RNA调控网络,探讨结直肠癌中分子调控机制。方法从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据,筛选差异表达RNAs,结合miRDB, miRcode, miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测结果,整合LncRNA-miRNA、miRNA-mRNA关系对,基于ceRNA假说及LncRNA细胞内定位,筛选出胞质表达并介导该网络调控的LncRNA,重建结直肠癌中lncRNA-miRNA-mRNA作用网络。结果在结直肠癌差异表达基因分析中初步筛选出119个LncRNA、32个miRNA以及59个mRNA;识别777对LncRNA-miRNA与77对miRNA-mRNA,基于ceRNA假说以及LncRNA在细胞内定位,最后筛选出15个上调LncRNA、3个下调miRNA(hsa-mir-145, hsa-mir-193b, hsa-mir-150)以及5个上调mRNA重建ceRNA网络。结论成功构建结直肠癌中LncRNA介导调控的ceRNA网络,识别出预后相关的潜在靶点,为结直肠癌治疗研究提供了新的参考依据。

• 单位
  武汉大学中南医院