远端上游元件结合蛋白1调节肝癌细胞中长链非编码RNA表达的实验研究

作者：张波; 李先鹏; 许丰; 姜玉华; 吴益峰; 陈颖

来源：现代实用医学, 2018, 30(06): 713-841.

• 远端上游元件结合蛋白1
• 长链非编码RNA
• 原发性肝细胞癌
• 共表达网络

目的筛选肝癌细胞中受远端上游元件结合蛋白1(FUBP1)调节的长链非编码RNA(lncRNAs)。方法通过慢病毒介导不同肝癌细胞株中(MHCC97H、MHCC97L和Huh7)过表达FUBP1,利用定量PCR的方法鉴定过表达效率。利用芯片的方法筛选过表达FUBP1后肝癌细胞株中差异表达的lncRNAs,并利用定量PCR验证结果。利用生物信息学的方法确定差异表达的lncRNAs与mRNAs的共表达网络。结果以对照组中FUBP1的表达量为1,慢病毒感染的MHCC97H、MHCC97L和Huh7肝癌细胞株中FUBP1的mRNA水平分别为3.28±0.15、2.75±0.26和4.25±0.35,明显高于对照组(均P<0.01)。芯片结果显示,共有12个lncRNA在3种细胞株中具有一致的表达变化,包括3个上调和9个下调。定量PCR验证结果与芯片结果一致,其中lnc-ARF6-3下调最明显,lnc-BCAS2-1上调最明显。lnc-BCAS2-1、lnc-USP9X-3、lncLYZ-2和lnc-C14orf135-3与FUBP1具有共表达网络。结论 FUBP1诱导肝癌细胞中lncRNAs的表达紊乱,FUBP1-lncRNAs的表达网络可能与肝癌的发展和转移密切相关。

• 单位
  宁波市鄞州人民医院