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摘要
【目的】挖掘调控‘麦缘锦楸’黄色边缘形成的关键基因，明确该候选基因的保守结构域、进化关系及表达特征，为下一步揭示该基因的分子生物学功能奠定基础。【方法】基于前期RNA-seq数据，筛选并克隆了与叶色相关的三角状五肽重复（pentatricopeptide repeat,CfPPR1）基因全长；利用ExPASy、InterProScan和CBS等在线工具对CfPPR1进行等电点、蛋白质结构及不同物种同源序列的进化关系和保守结构域分析；比较了CfPPR1基因在不同光照强度下的表达模式。【结果】该CDS序列全长为1902 bp，编码633个氨基酸，推测蛋白相对分子质量为71.31kD，理论等电点（pI）为7.26；二级结构分析发现，CfPPR1序列编码的蛋白质空间结构是相对稳定的。系统进化树结果显示，CfPPR1不仅与黄化风铃木、芝麻、丹参等菊分支植物聚为一支，还与非菊分支的苹果、桃和橡胶树等具有较高的同源性，说明CfPPR1具有较高的保守性。对CfPPR1基因的表达模式分析发现，CfPPR1基因表达的上调很可能参与调控了‘麦缘锦楸’黄色边缘的形成。【结论】首次克隆得到了与叶色相关的CfPPR1基因，该基因的获得为进一步后期转基因验证CfPPR1基因功能提供有价值的参考。
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