鸡传染性喉气管炎病毒微滴式数字PCR定量检测方法的建立

作者:谢志勤; 谢芝勋*; 张艳芳; 范晴; 谢丽基; 万丽军; 罗思思; 李孟; 张民秀; 曾婷婷; 黄娇玲; 王盛; 李丹; 韦悠; 李小凤; 任红玉; 阮志华
来源:西北农业学报, 2023, 1-8.

摘要

旨在建立检测鸡传染性喉气管炎病毒(infectious laryngotracheitis virus,ILTV)绝对定量方法。根据已发表的鸡ILTV的TK基因序列,针对其保守区域分别设计1对特异引物和1条探针,建立检测鸡ILTV的微滴式数字PCR(droplet digital PCR,dd PCR)方法,并评价其特异性、敏感性和重复性。结果显示,建立方法的最佳引物浓度为20μmol/μL,最佳探针浓度为10μmol/μL,最佳退火温度为56℃。特异性检测结果显示,建立的方法只检出ILTV,没有检出其他病原株。敏感性检测结果显示,采用建立的方法定量检出ILTV重组质粒标准品的最低限为4.6拷贝/μL。对3个连续稀释的p MD18-ILTV重组质粒DNA进行检测,3次重复检测结果的变异系数均小于5%。对83份病鸡喉拭子、肺及脾组织样品进行检测,采用建立的dd PCR检出ILTV阳性样品10份,荧光定量PCR检出ILTV阳性样品9份,dd PCR的阳性检出率(12.05%)高于荧光定量PCR的阳性检出率(10.84%)。结果表明,建立的dd PCR方法定量检测ILTV特异性强、敏感性高、重复性好,为绝对定量检测ILTV提供更好的技术支撑。