贵州汉族人群21个非CODIS STR基因座的遗传多态性分析

作者：张红玲; 蔡鹏; 熊玲; 罗文钰; 杨美庆; 徐荣兰; 王启燕; 任峥; 季晶焱; 黄江^*

来源：贵州医科大学学报, 2021, 46(02): 159-164.

DOI：10.19367/j.cnki.2096-8388.2021.02.006

• 法医遗传学
• 非DNA检索系统
• 贵州汉族
• 遗传多态性
• 短串联重复序列
• 亲权鉴定
• 个体识别

目的调查贵州汉族人群21个非DNA检索系统(CODIS)的短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,并评估其在法医学上的应用价值。方法选取301例贵州汉族无关个体血样,采用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对样本进行聚合酶链式反应(PCR),3500型全自动遗传分析仪对PCR扩增产物进行电泳分离,Gene Mapper ID-X 1. 3软件进行STR基因分型,Modified-Powerstates软件包获得各基因座的等位基因频率、杂合度(H)、匹配概率(PM)、个体识别率(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)、累积个体识别能力(TDP)、累积非父排除率(CPE)及各基因座的Hardy-Weinberg平衡检验,采用Genepop软件对两两基因座进行连锁不平衡分析;同时选择已报道的7个地区汉族人群作为参考,对8个汉族人群基因频率进行主成分分析(PCA),应用MEGA 7. 0软件通过Neighbor-Joining(N-J)法构建8个地区汉族人群的系统发育树。结果 21个STR基因座共检测出了157个等位基因,436种基因型,基因频率介于0. 001 7～0. 584 7,PM介于0. 052 6(D19S433)～0. 226 8(D1S1627),DP介于0. 773 2(D1S1627)～0. 947 4(D19S433),PE介于0. 272 9(D1S1627)～0. 586 7(D22S1045),PIC介于0. 533 2(D1S1627)～0. 803 0(D19S433); TDP为1-4. 645 5×10-20,CPE为0. 999 998 822;与已报道的7个汉族群体比较,贵州和湖南汉族人群遗传关系最近,与宁夏汉族份遗传关系最远。结论 21个非CODIS STR在贵州汉族人群具有较好的多态性及个体识别能力,可作为法医学亲权鉴定和个人识别的有效补充。

• 单位
  贵州医科大学