高通量技术分析‘砂蜜豆’甜樱桃不同组织内生细菌多样性

作者：赵柏霞; 闫建芳

来源：中国农业科技导报, 2023, 25(03): 66-77.

DOI：10.13304/j.nykjdb.2021.0647

• 甜樱桃
• 内生细菌
• 种群多样性
• 不同组织
• 高通量测序

为探明甜樱桃内生细菌种群结构及多样性，以‘砂蜜豆’甜樱桃根、主干树皮和枝条3个组织的内生细菌为研究对象，对其16S rRNA V3～V4区进行高通量测序。结果表明，‘砂蜜豆’甜樱桃不同组织内生细菌群落多样性及功能存在较大差异。不同组织中共获得有效序列9 665 813条，聚类为1 386个OTU(operational taxonomic units)，隶属于20个门、43个纲、79个目、162个科和346个属。在门水平，变形菌门（Proteobacteria）在各组织中的丰度均最高，是最优势菌门。在属水平，根部内生细菌的优势菌属为链霉菌属（Streptomyces）、类固醇杆菌属（Steroidobacter）和乳酸杆菌属（Lactobacillus）；枝条内生细菌中鞘氨醇单胞菌（Sphingomonas）的相对丰度较高；主干树皮内生细菌的优势菌属为拟杆菌属（Bacteroides）。PICRUSt (phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states)基因预测表明，内生细菌功能主要涉及多糖、萜类和酮类、酶及维生素等次生代谢产物的生物合成。综上所述，甜樱桃内生细菌具有丰富的种群多样性，为今后开发利用甜樱桃内生细菌资源奠定了基础。

• 单位
  大连民族大学; 生命科学学院; 大连市农业科学研究院