基于线粒体COI基因的3种草蛉的系统发育关系分析

作者：胡红岩; 张职显; 卢珍华; 任相亮; 马小艳; 马亚杰; 宋贤鹏; 马艳^*

来源：云南农业大学学报：自然科学版, 2021, 36(06): 937-943.

• 草蛉
• 线粒体COI基因
• DNA条形码
• 遗传距离
• 系统发育树

【目的】基于线粒体COI基因片段测序及分析,研究3种草蛉的系统发育关系,探讨DNA条形码准确鉴定草蛉种类的可行性。【方法】利用PCR扩增和测序技术,获得来自不同地区的12个样本3种草蛉的COI基因片段序列。运用DNAMAN软件对序列进行拼接比对,并从GeneBank数据库中下载9种草蛉的COI序列,利用MEGA 7.0软件对23条序列进行碱基序列分析、遗传距离分析及系统发育分析。【结果】序列保守位点469个,变异信息位点188个,简约信息位点150个,自裔位点38个。序列中A、T、G和C的含量分别为28.6%、41.1%、15.4%和14.9%;A+T含量(69.7%)高于G+C含量(30.3%),呈现出明显的A+T碱基偏好。草蛉种内遗传距离为0～0.005,种间遗传距离为0.022～0.184。在系统发育树(最大似然法/邻接法)中,同一属的物种以较高的置信度聚类在一起。【结论】基于COI基因片段的DNA条形码技术可以用于草蛉的分类鉴定。

• 单位
  中国农业科学院棉花研究所; 棉花生物学国家重点实验室