宏基因组分箱技术在反刍动物研究中的应用

作者：陈天镕; 王志立; 王佳堃^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(09): 82-87.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220701-06

• 分箱
• 宏基因组
• 反刍动物
• 微生物

消化道微生物在宿主营养与免疫方面发挥重要作用。随着测序技术的进步，微生物研究越来越依赖高通量测序结果的解读。然而受测序读长的限制，将较短的DNA片段(Read)组装(Assemble)成较长的叠连群(Contig)或序列骨架(Scaffold)已成为解读宏基因组数据的必经操作。但每条contig承载的信息量仍然太少，不足以支撑微生物功能的深入研究。分箱(Binning)技术能从混合样本中区分出来自同一微生物的序列，获得较完整的微生物基因组，被越来越多地应用于微生物研究中。反刍动物依赖瘤胃微生物消化分解饲粮供能，且瘤胃微生物的组成更为复杂多样，因此，本文综述了分箱技术的优势与功能及其在反刍动物研究中的应用，为进一步应用分箱技术研究反刍动物消化道微生物提供参考依据。

• 单位
  浙江大学