分子传播网络技术在艾滋病传播性耐药检测中的应用

作者：袁丹; 阿皮拉则; 杨淑娟; 苏玲; 李一平; 杨洪; 叶黎; 杨文; 刘红露; 梁姝^*

来源：现代预防医学, 2019, 46(21): 4014-4025.

• 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)
• 耐药
• 传播性耐药检测
• 分子传播网络

目的分析凉山州布拖县特木里镇、木尔乡和九都乡(后称"两乡一镇")艾滋病耐药毒株传播情况,利用分子传播网络技术分析耐药毒株传播来源。方法采集2017年布拖县两乡一镇新报告未治疗的HIV-1感染者的血浆样本,扩增HIV-1 pol基因区蛋白酶和逆转录酶1.2 kb片段,进行耐药分析,同时应用HyPhy2.2.4与Cytoscape3.6.1软件与凉山州近年接受治疗且耐药患者的序列构建分子网络,分析耐药传播情况。结果在174份血样中获得119条(68.39%)有效分析序列,13例(10.92%)出现了耐药突变,其中CRF08BC亚型毒株耐药率高于CRF07BC亚型和C亚型毒株(■=6.884,P=0.032),地区、年龄、职业、婚姻、文化和传播途径耐药率差异无统计学意义。在11例(84.62%)CRF07BC亚型毒株中,3例在分子网络中与治疗患者耐药序列成簇,2例K103N突变,1例Q58E突变,其中1例为家庭内传播,其余2例与成簇序列患者关系不详。结论布拖县两乡一镇艾滋病耐药率较高,达到中度耐药传播水平,运用分子传播网络技术,能进一步发现新报告耐药患者毒株的传播来源。

• 单位
  公共卫生学院; 四川大学; 四川大学华西第四医院; 四川省疾病预防控制中心