摘要
目的 探讨DnaJ热休克蛋白家族成员B11(DNAJB11)在尤文氏肉瘤(ES)中的预后、诊断价值及与免疫细胞浸润的关系,并预测具有潜在治疗价值的药物。方法 利用GEO数据库分析DNAJB11在ES样本与正常样本中的表达水平差异,并使用荧光定量PCR(RT-qPCR)进行验证。随后获取ICGC数据库中56例ES的RNA测序(RNA-seq)数据和临床相关信息进行后续分析,根据DNAJB11表达水平将患者分为高表达组、低表达组,通过“limma”包鉴定两组间的差异表达基因。采用Kaplan-Meier生存分析、单因素和多因素COX分析及受试者工作特征(ROC)曲线分析DNAJB11表达水平对ES患者预后的影响,GO和KEGG富集分析DNAJB11在ES病理进展中可能参与的生物学途径,ssGSEA算法分析DNAJB11表达水平与ES免疫细胞浸润的关系,CMap数据库筛选对ES具有治疗潜力的药物。结果 结合GEO、ICGC数据库与RT-qPCR分析结果发现,DNAJB11在ES中呈高表达(P<0.05),且DNAJB11高表达与ES发生转移有关。Kaplan-Meier生存曲线分析显示DNAJB11高表达与ES患者较差的预后相关(P=0.029)。多因素COX分析显示DNAJB11高表达是ES患者预后的独立危险因素(P=0.002,HR=1.055,95%CI:1.020~1.091)。ROC曲线分析显示,DNAJB11对ES预后有一定的预测价值。GO和KEGG富集分析显示,DNAJB11主要参与内质网应激反应、抗原加工及呈递和主要组织相容性复合体Ⅱ类蛋白复合物结合等通路。ssGSEA免疫评分结果提示DNAJB11高表达组具有较高的免疫细胞浸润丰度。CMap分析提示粗糠柴毒素、甲氟喹和依米丁可能是治疗ES的潜在治疗药物。结论 DNAJB11高表达预示患者预后较差,并对ES免疫微环境有一定的影响,DNAJB11有望成为治疗ES的新的生物靶点。
-
单位河南大学; 河南省人民医院