为提高铁路集装箱运输效率，提升铁路集装箱运输服务质量，学者们参照旅客运输模式建立集装箱旅客化运输系统。研究针对该系统运输组织模式的日常工作计划编制问题，建立混合整数规划模型，结合集装箱运输特点设置箱流批次，确定箱流分配方案。模型优化的目标是在箱流量超过运输能力时，使箱流运输量最大；箱流量较小时，使箱流分配较为均衡。以连云港—阿拉山口运输通道为例，研究结果表明，构建的优化模型能够提升箱流分配均衡性，保障滞后箱流优先运输，提升路网运输的运输效率，证明了模型的有效性。
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