鰤鱼诺卡氏菌特异性PCR检测方法的建立

作者：陈国权; 黄碧艳; 张子雯; 莫静怡; 柯玉涵; 夏立群^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, Z2: 2656-2665.

DOI：10.13417/j.gab.040.002656

• 鰤鱼诺卡氏菌
• 基因组片段
• 检测方法
• 特异性

鱼类诺卡氏菌病(fish nocardiosis)是一种常见的严重危害全球水产养殖业的鱼类疾病。鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)是鱼类诺卡氏菌病的主要病原菌之一。本研究对已报道的鰤鱼诺卡氏菌17个不同菌株全基因组数据进行比对分析，筛选获得种内保守、种间变异的特异性基因组片段，并设计特异性引物，建立鰤鱼诺卡氏菌特异性PCR检测方法。设计的特异性引物仅能扩增获得鰤鱼诺卡氏菌的特异性片段，其他近缘菌和常见菌均无PCR扩增片段，且PCR检测灵敏度核酸浓度达80 pg/μL，菌液浓度达8.6 CFU/μL。用该PCR检测方法检测人工感染鰤鱼诺卡氏菌和阴性对照组杂交鳢各组织，结果显示，只能从感染鰤鱼诺卡氏菌的鱼组织中扩增出阳性片段。本研究基于鰤鱼诺卡氏菌不同菌株全基因组数据比对分析，所建立的PCR检测方法比之前的分子检测方法更具科学性、可靠性。该PCR检测方法可以提供一种快速、准确、灵敏的鰤鱼诺卡氏菌检测方式。

• 单位
  广东海洋大学深圳研究院; 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室; 广东海洋大学