不稳定动脉粥样硬化斑块中铜死亡相关特征基因的鉴定

作者：贺天文; 朱浩彦; 鲁志兵^*

来源：武汉大学学报(医学版), 2023, 1-7.

DOI：10.14188/j.1671-8852.2023.0195

• 铜死亡
• 不稳定动脉粥样硬化斑块
• 基因表达
• 机器学习

目的：通过生物信息学鉴定铜死亡和动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的特征基因。方法：从基因表达综合数据库下载动脉粥样硬化斑块相关数据集GSE163154、GSE41571、GSE43292。合并三个数据集，根据收集到的铜死亡相关基因（CRGs）对合并后的数据集进行差异表达分析。使用三种机器学习算法筛选差异表达的CRGs中的特征基因，并通过外部数据集GSE28829验证了结果。结果：共鉴定出27个差异表达的CRGs。基于3种机器学习算法（LASSO、RF和SVM-RFE），筛选出5个特征基因ATOX1、NLRP3、MAP1LC3A、SLC31A1和ATP7B。在外部数据集中通过受试者工作特性（ROC）曲线验证诊断效能。结论：结果表明，铜死亡与动脉粥样硬化斑块的不稳定性密切相关，为不稳定动脉粥样硬化斑块的发病机制和治疗提供了新的见解。

• 单位
  武汉大学中南医院