科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
应用Illumina HiSeq测序技术,对中国沙棘雌雄株叶片分别进行了转录组测序,实验共获得48.31 G有效数据,平均错误率为0.015%。经Trinity软件混合拼接后共得到320 876条Transcripts和187 362条Unigenes,平均长度分别为808 bp和588 bp,最大长度均为17 291 bp。将Unigenes与公共数据库进行比对,得到注释的Unigenes为104 926条,占总数的56%。转录组数据经搜索共得到33 248个微卫星标记。中国沙棘雌株和雄株转录组基因表达量差异比较数据显示,雌雄样本间表达差异基因共92 970个。上述工作不仅为中国沙棘的基因克隆和基因挖掘提供了基础数据,也为初步阐明中国沙棘性别决定的分子机制打下了基础。
- 单位
