iTRAQ技术检测烟雾病病人硬脑膜特异性蛋白表达

作者：张小军; 尹林; 刘思远; 张丽军^*

来源：中国临床神经外科杂志, 2021, 26(04): 261-265.

DOI：10.13798/j.issn.1009-153X.2021.04.012

• 烟雾病
• 硬脑膜
• 蛋白质组
• 生物信息学
• 组织芯片
• 同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)

目的优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质。方法收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定,用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术进行标记、分离和鉴定差异蛋白质,应用R语言和生物信息学分析筛选MMD相关蛋白质,再应用组织芯片技术验证差异蛋白质表达。结果胶原酶Ⅳ消化、液氮研磨和十二烷基硫酸钠法提取硬脑膜蛋白质效果较好;iTRAQ技术和生信分析发现23个差异蛋白质,组织芯片结果证实MMD病人硬脑膜组织SLC4A1蛋白表达明显下调。结论 iTRAQ技术可以很好地进行标记、分离和鉴定硬脑膜组织差异蛋白质,SLC4A1可能在MMD发病过程中具有一定的作用。

• 单位
  上海师范大学; 机电工程学院; 上海市公共卫生临床中心