花生WRI1基因家族的全基因组与表达谱分析

作者：孙金波; 石素华; 杨利; 李凤丽; 王兴军^*; 赵术珍^*

来源：花生学报, 2020, 49(01): 9-18.

DOI：10.14001/j.issn.1002-4093.2020.01.002

• 花生
• WRI1转录因子
• 生物信息学分析
• 基因表达

花生(Arachis hypogaea L.)是世界范围内重要的油料与经济作物之一。转录因子WRINKLED1(WRI1)在植物油脂生物合成途径中起着重要作用。尽管花生基因组序列已经公布,但国内外尚缺乏对花生中WRI1基因家族的全基因组分析。本研究从二倍体花生野生种和四倍体栽培种的参考基因组中鉴定出20个WRI1转录因子,经分析表明它们均为亲核蛋白,位于细胞核内,二级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成,20个WRI1基因的结构中含有5～8个内含子。系统发育分析表明,花生WRI1基因与其他物种的WRI1成员有密切关系。转录组数据表明种子中WRI1表达高于其他组织,q RT-PCR结果进一步表明WRI1表达随种子成熟水平逐渐增加。本文对花生基因组中WRI1全基因组的鉴定和表达分析,为进一步探讨WRI1基因在种子发育过程中的功能提供了依据。

• 单位
  山东大学; 山东省农业科学院; 山东师范大学; 生命科学学院