利用gyrB基因鉴定芽孢杆菌近缘种

作者：宗凯; 盛旋; 尤征合; 吕侠影; 孙娟娟; 李云飞; 张萍; 余晓峰^*

来源：中国口岸科学技术, 2020, (10): 52-57.

• 芽孢杆菌
• 16S rDNA
• gyrB基因
• 鉴定

本试验从一批药品中分离到11株疑似芽孢杆菌菌株,采用VITEK 2 systems compact生化鉴定系统和16S rDNA基因测序技术对其进行鉴定。结果显示,除2株株菌(6号菌株鉴定为Microbacterium oleivorans,8号菌株鉴定为Moraxella osloensis),其他9株株菌均属于芽孢杆菌属(Bacillus)。但仅通过VITEK 2 systems compact鉴定和16S rDNA测序比对,均不能鉴定到种。因此,进一步选择gyrB基因以及其blast分析结果构建系统发育树,最终将1～5号菌株分别鉴定为B. oceanisediminis(99.08%),B. korlensis(90.71%),B. licheniformis(100%),B. marisflavi(97.26%),B.oceanisediminis(99.22%),9～12号菌株分别鉴定为B. megaterium(99.83%),B. boroniphilus(81.20%),B. jeotgali(90.70%),B. humi(81.39%)。实验表明,利用16S rDNA与gyrB基因结合的方式能较好地将芽孢杆菌属鉴定到种,是一种快速准确的芽孢杆菌种间鉴定方法,适合于药品中分离菌株的种属及近缘种的鉴定与区分。

• 单位
  合肥海关技术中心