HLA新等位基因B*46:30序列分析及其编码MHC蛋白分子结构预测与表型鉴定

作者：聂向民; 朱传福; 朱海峰; 张毅; 乔文本; 刘艳; 邵静茹

来源：中国免疫学杂志, 2023, 39(01): 152-161.

• 人类白细胞抗原
• 测序分型
• 新等位基因
• 结构预测

目的：鉴定分析HLA新等位基因B*46:30序列，对其MHC蛋白分子三级结构及氨基酸残基改变对蛋白结构的可能影响进行模拟分析，并对其血清学表型进行鉴定。方法：应用Luminex SSOP流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对HLA序列进行序列鉴定。应用SWISS-MODEL及RCSB PDB分析软件，对HLA序列蛋白分子三维结构进行模拟分析。HistoCheck、FATCAT对比分析蛋白分子间差异。使用Terasaki分型板进行血清型表型鉴定。结果：相较于B*46:01，新等位基因B*46:30第559、560位发生C->G、T->A替代。MHC分子结构预测分析表明，B*46:30第163位氨基酸残基由疏水性脂肪族亮氨酸Leu→B*46:30带负电荷的酸性谷氨酸Glu,R值为32。该氨基酸变异位置位于α2结构域构成抗原多肽结合凹槽侧壁的α螺旋顶端，总差异值DSS Score=1.32，均方根偏差RMSD=0.59?，血清型表型检测为B46强阳性。结论：HLA新等位基因序列被WHO HLA命名委员会正式命名为B*46:30，分析预测此编码氨基酸残基改变将可能影响其抗原多肽结合功能，并影响其与TCR及抗体的结合特性，血清型表型鉴定为B46。

• 单位
  山东省血液中心