生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证

作者：沈蕾; 王惠民; 季伙燕; 沈培; 王建新

来源：临床检验杂志, 2017, 35(06): 444-447.

DOI：10.13602/j.cnki.jcls.2017.06.13

• 半胱氨酸蛋白酶抑制剂C
• 生物信息学技术
• 特异性肽段
• 质谱

目的用生物信息学技术分析半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(Cys C)的特异性肽段及其性质,并用质谱技术验证预测结果。方法用在线软件工具分析胰蛋白酶水解Cys C产生的肽段和同源性,预测特异性肽段质谱扫描离子化碎片信息;对人工合成的特异性多肽样品进行母离子扫描和子离子扫描,人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解后分析质谱,比较分析结果与预测结果。结果选择T3(ALDFAVGEYNK)肽段作为Cys C的特异性肽段,用串联质谱对T3样品[M+2H]2+进行子离子扫描,几乎可发现Skyline软件预测的所有b离子和y离子。人重组Cys C和血清样品经胰蛋白酶水解出的肽段与T3*在同一时间出峰。结论用生物信息学技术快速准确地筛选出了Cys C特异性肽段并准确预测该肽段质谱扫描离子化碎片。

• 单位
  南通大学附属医院