不同氧浓度下猪睾丸间质细胞转录组分析

作者：陈楷文; 赵云娇; 王磊; 张剑搏; 马玉红; 吴国芳^*

来源：中国畜牧兽医, 2023, 50(06): 2185-2195.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.06.002

• 缺氧
• 猪睾丸间质细胞
• 生殖损伤
• 转录组测序

【目的】研究不同氧浓度下猪睾丸间质细胞表达谱差异，筛选缺氧导致猪睾丸间质细胞损伤的关键基因。【方法】将猪睾丸间质细胞分为缺氧组(1%氧气，H24组)、正常组(15.75%氧气，N24组),每组3个重复，在相应条件下分别处理24 h,用CCK8法检测细胞存活率；利用转录组测序技术筛选出缺氧组和正常组睾丸间质细胞中的差异表达基因，利用DESeq 2.0软件进行差异表达基因分析，并对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，进一步筛选与氧含量相关的调控基因。【结果】缺氧刺激24 h后，与正常组相比，缺氧组猪睾丸间质细胞存活率极显著降低(P<0.01);转录组测序共获得1 654个差异表达基因，其中1 242个基因上调，412个基因下调。GO功能富集分析发现，共获得富集条目8条，其中生物过程1条，分子功能7条；KEGG通路富集分析发现，共获得10个显著富集的信号通路，包括HIF-1信号通路、JAK-STAT信号通路和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。通过GO功能和KEGG通路富集分析共获得6个与缺氧应激相关的基因，分别为信号传导及转录激活蛋白5(signal transducer and activator of transcription 5,STAT5)、白细胞介素-8(interleukin-8,IL-8)、CC基元趋化因子配体2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2)、Ⅰ型干扰素受体1(interferon alpha and beta receptor subunit 1,IFNAR1)、细胞因子信号传导抑制因子1(suppressor of cytokine signaling 1,SOCS1)和红细胞生成素(erythropoietin, EPO)。【结论】本研究通过对不同氧浓度下猪睾丸间质细胞进行转录组分析，获得了SOCS1、IFNAR1、EPO、STAT5、IL-8和CCL2 6个与猪睾丸间质细胞缺氧损伤和应激修复相关的基因，为解决高原地区公猪生殖能力低下的研究提供参考。

• 单位
  青海省畜牧兽医科学院; 青海大学