冠心病与生物钟关联靶基因的生物信息学挖掘

作者：王文栋; 苏翰博; 樊茜茜; 李喜龙; 常晓彤^*

来源：医学研究与教育, 2020, 37(05): 1-13.

• 生物钟
• 冠心病
• 生物信息学
• 染色体定位
• 富集分析

目的分析生物节律紊乱与冠心病发生关联的潜在分子机制。方法从GEO数据库中获取GSE71226芯片数据,用R软件筛选冠心病差异表达基因;经文本挖掘和蛋白互作分析获得生物钟相关基因,进行功能注释、染色体定位和互作分析。结果获得488个冠心病差异表达基因(coronary heart disease differentially expressed genes, CHD-DEGs)和64个生物钟相关基因(biological clock related genes, BRGs),在染色体上分布密集,且多与转录调控、炎症和免疫系统疾病相关。其中28个CHD-DEGs与22个BRGs发生了显著互作,有10个重要关联靶基因。结论生物节律紊乱与冠心病的发生之间存在着密切的关联。

• 单位
  河北北方学院