一种MicroRNA duplex设计新技术研究

作者：周珏宇; 马文丽; 丁大鹏; 石嵘; 郑文岭

来源：生命科学研究, 2006, 10(2): 109-112.

DOI：10.3969/j.issn.1007-7847.2006.02.004

• 微RNA
• siRNA
• 生物信息学分析
• 热动力学性质

利用microRNA数据库,获取3种微RNA mir-181a、mir-124和mir-1的成熟序列信息.基于siRNA duplex在形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-induced silencing complex,RISC)过程中的不对称性的特点,初步设计了针对上述3种微RNA的microRNA duplex.采用生物学软件Oligo 6.0分别评价其热动力学特性,并通过改变反义链3'端个别碱基序列使其满足热动力学的需求,从而确定最终的设计序列.结果显示,利用RISC形成过程的不对称性,结合生物学软件Oligo 6.0的热动力学分析来设计miRNA duplex,是一种简便可行、准确有效的方法.

• 单位
  南方医科大学