前列腺癌差异性下调lncRNA的数据挖掘及表达分析

作者：万佳慧; 王孝锦; ***; 姜世君; 崔荣军^*

来源：牡丹江医学院学报, 2019, 40(02): 33-36.

DOI：10.13799/j.cnki.mdjyxyxb.2019.02.009

• 下调Lnc RNA
• EMX2OS
• 差异表达
• 前列腺癌

目的筛选前列腺癌中差异性下调的lnc RNA。方法从TCGA数据库获取前列腺癌和癌旁组织的基因表达数据;利用R语言中Edge R程序包筛选前列腺癌中表达下调的lnc RNA;分析排名最靠前的lnc RNA在前列腺癌不同种族、年龄、Gleason评分的临床样本中的差异表达; Graph Pad Prism绘制ROC曲线; KEGG分析获取相关信号转导通路。结果筛选出前列腺癌组织中显著下调的lnc RNA166种,其中EMX2OS排名最靠前; EMX2OS能够区分前列腺癌组织与癌旁组织;不同种族、不同Gleason评分、不同年龄前列腺癌组织EMX2OS的表达与癌旁组织相比显著降低(P<0.01); Gleason评分为7与Gleason评分为9的前列腺癌组织相比,EMX2OS的表达显著降低(P<0.05); EMX2OS的相关基因主要富集于c GMP-PKG、血管平滑肌收缩、钙离子等与肿瘤的发生发展密切相关的信号转导途径。结论筛选出前列腺癌组织显著低表达的lnc RNA EMX2OS,有望成为前列腺癌的诊断标志。

• 单位
  大庆医学高等专科学校; 齐齐哈尔市第七医院; 牡丹江医学院